養殖場是將一定數量的豬,牛等野生動物集中到特定區域內統一飼養、繁殖的場所。應及時清除養殖場舍內糞便污水，應特別注意死角中的糞便和污水，盡可能保持糞便干燥，盡可能做到每天清理一次。搞好舍內外的清潔衛生，定期消毒。妥善處理清除的糞便，及時拉走并進行無害化處理。場內的廢舊墊料和病死畜禽也要妥善處理。
牲畜飼養場排出的廢水種類有：糞便廢水、生產污水、生活污水和雨水(污染嚴重和不嚴重的廢水)，而與禽飼養場生成的廢水種類中，除不產生糞便廢水外，其他各種廢水同性畜飼養場。牲畜場糞便廢水水量為，養豬18～37升/(日·頭)，大牲畜56～256升/(日·頭)；廢水水質中懸浮物為養豬15～30g/L、大牲畜30～50g/L，COD為，養豬15～30g/L，大牲畜35-60g/L，BOD6為，養豬6.25～12.5g/L、大牲畜4～6.7g/L。多此外，尚含有大量氮、磷、鉀等。
這些污水排放前需先經局部預處理，預處理構筑物常采用格柵、格網、沉淀池、水力旋流器等。牲畜場糞便污水經均質、沉砂池處理后，常采用氧化塘和二級曝氣生化處理后排放，亦可再經過濾及臭氧化法處理后回用于生產，有時也可用于灌溉農田或排放。污泥經脫水處理后亦可用作農肥。牲畜場及鳥禽場生產污水常采用天然或人工生化處理。雨水經沉淀處理后可用于稀釋糞便廢水以利于灌溉
養殖污水具有典型的“三高”特征即有機物濃度高COD高達3000-12000mg/l，氨氮高達800-2200mg/l，懸浮物多SS超標數十倍，色度深，并含有大量的細菌，氨氮、有機磷含量高。可生化性好，沖洗排放時間集中，沖擊負荷大。
根據水質特點，先去除懸浮物與色度，采用混凝沉淀工藝，有機物、氨氮、有機磷采用生化處理，因污染物濃度高，從成本及處理效果考慮，采用厭氧+好氧處理工藝。
（1）（厭氧+缺氧+好氧）活性污泥法的優勢：
該方法綜合了厭氧、好氧法的優勢，CODCr、BOD5、SS去除率較高，可達標排放；可處理高濃度有機污水，自身能耗少，運行費用低，可產生沼氣等清潔能源，克服了好氧處理能耗大或占地多的不足，避免了好氧、厭氧各自存在的缺陷，運行費用低，處理效果好，適合高濃度有機廢水。
（2）固定化微生物強化技術的優勢：
①處理效果好
固定化微生物強化技術針對不同的養殖類型及污水屬性，匹配相應的功能性復合菌群，使處理指標和工藝更具有針對性，較傳統方法的處理效率提高20-30%。
②投資費用低
該技術由于其自身的特點，可有效減少設備投入，同時其具有的高效性和專一性，能大大縮短糞污的處理周期，從而使相應的構筑物容積縮小10%-40%，有效降低項目總投資成本。
③運行費用低
構筑物容積減小的同時，所需設備的數量及功率等也會相應減小，從而使電耗費用減少；另外，功能性微生物能夠高效利用糞污中的有機質作為自身的能量來源，因此整個處理過程中不需要添加過多的外來能源，整體運行費用大大減少。
④剩余污泥少
由于固定化微生物處理的污泥轉換率低，在高微生物濃度下內源呼吸量大，因此剩余污泥量較傳統活性污泥法減少25%-35%，這也為業主省去污泥脫水設備或減小了污泥脫水機的規格及數量，減少了投資和運行費用。
⑤調試周期短
由于該技術采用人工干預的方法，針對性的投加菌種，大大縮短了優勢菌群的馴化周期，從而使啟動周期較傳統方式縮短30%-50%；另外，中斷運行后再恢復周期也大大縮短。
⑥微生物流失少
傳統的活性污泥法靠自然沉降進行分離，易使分解能力較高的微生物因形成懸浮狀而流失。當釆用固定化微生物技術時，微生物的利用與絮凝條件無關，微生物流失較少，使増殖速度緩慢的微生物也可得到充分利用，從而將氨氮的去除效率提高了50%左右。
⑦無二次污染
由于固定化微生物的高效性和專一性，在處理過程中不添加或少量添加絮凝藥劑，因此排出的污泥不存在重金屬超標等問題，不會造成二次污染，可直接用于有機肥加工。
⑧能有效降低病原菌的數量
有益菌劑的投加，降低了廢水中大腸桿菌等病原菌的數量，有效預防了因病原菌超標導致的動物疾病。
⑨能維持較高的微生物濃度
一般情況下，反應器中的微生物濃度越高，則需要的反應時間越短，并有利于污水處理設備的小型化。傳統的活性污泥法，微生物濃度雖然隨著負荷的增加而提高，但達到一定程度后，因流失嚴重而無法繼續增加。當釆用固定化微生物技術時，微生物濃度可得到極大的提高，其負荷是傳統活性污泥法的7-8倍。
⑩易實現固液分離
微生物在不溶性載體上固定后，使固液分離變得容易，分離速度加快，分離后的出水中剩余微生物量很少，因此不需要大型沉淀池。